Benih tanaman adalah bagian terpenting dari Harvest moon : Back to Nature. Selain itu kamu juga masih dapat mengumpulkan uang dengan cara menambang dan membuat resep. Milikilah benih-benih yang dapat tumbuh di musim tertentu, kecuali untuk musim dingin, karena tidak ada yang dapat kamu tanam ataupun kamu ambil dari luar ladangmu. Ada beberapa jenis yang lebih menguntungkan jika ditanam, tetapi akan lebih baik jika kamu menanam semua benih sehingga kamu dapat membuat suatu masakan berdasarkan resep-resep yang ada dan dapat pula diberikan kepada orang lain sebagai hadiah.

Aturlah waktu kerjamu, seberapa keras kamu harus bekerja. Upgrade peralatan dan suruhlah Harvest Sprites untuk meringankan bebanmu untuk bekerja di kebun. Jika tidak demikian maka kamu akan menghabiskan sebagian besar waktumu di kebun bahkan hampir tidak dapat menjelajahi bagian lain dari game ini.

Pertama-tama kamu harus menentukan benih apa yang akan ditanam. Pada mulanya hasil panenmu tidak akan seberapa, tapi semakin lama kamu dapat membeli apa saja yang kamu inginkan. Pada permulaan musim, tanamlah benih tersebut, jika kamu tidak memiliki waktu untuk mengairi dan menuainya, pekerjakanlah beberapa Harvest Sprites.

Ada 4 musim dalam game ini :
Musim semi (spring)
Musim panas (summer)
Musim gugur (fall)
Musim dingin (Winter) (tidak dapat berkebun)

Kamu dapat menanam benih yang berbeda pada tiap musimnya. Saat mulai permainan, kamu akan berada pada musim semi pertama. Asalkan kebunmu cukup mendapat air, kamu tidak perlu membeli beberapa jenis bibit baru hingga melewati pergantian musim.